報告時間：2022年8月24日 周三 13：00-14：00
報告主題：基于深度學(xué)習(xí)的生物圖像計算分析技術(shù)與應(yīng)用
嘉賓介紹：楊戈博士
騰訊會議：421-297-024
 

楊戈 博士
 
1991年于清華大學(xué)獲機(jī)械工程與自動控制雙學(xué)士學(xué)位，1998年于中國科學(xué)院自動化研究所獲自動控制（機(jī)器人學(xué)）碩士學(xué)位，2004年于美國明尼蘇達(dá)大學(xué)獲機(jī)械工程（機(jī)器人學(xué)）博士學(xué)位。2004-2008年在美國加州斯克里普斯研究所完成計算細(xì)胞生物學(xué)博士后，2009-2018在美國卡內(nèi)基梅隆大學(xué)生物醫(yī)學(xué)工程系和計算生物學(xué)系任助理教授和副教授。2019年入選中國科學(xué)院杰出海外人才引進(jìn)計劃，全職回國任中國科學(xué)院自動化研究所模式識別國家重點實驗室研究員，中國科學(xué)院大學(xué)人工智能學(xué)院長聘教授。曾獲美國國家科學(xué)基金青年科學(xué)家(CAREER)獎，國際生物醫(yī)學(xué)圖像會議(ISBI)最佳論文獎等。主要研究方向為基于人工智能的生物醫(yī)學(xué)圖像處理,計算細(xì)胞生物學(xué)與藥物篩選技術(shù)。目前已在國際知名學(xué)術(shù)期刊如Nature Cell Biology，Journal of Cell Biology，PNAS, Cell Reports, Bioinformatics和國際知名學(xué)術(shù)會議如AAAI, ISBI等發(fā)表論文近90篇。
 
報告介紹：現(xiàn)代高性能光學(xué)成像技術(shù)為生命科學(xué)提供了大量高質(zhì)量且信息豐富的圖像數(shù)據(jù)，然而在對于這些圖像的定量分析和信息提取方面目前還存在很多挑戰(zhàn)。深度學(xué)習(xí)是一類采用多層人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)又稱深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的人工智能技術(shù)。近年來，深度學(xué)習(xí)技術(shù)在生物顯微圖像的定量分析和信息提取方面實現(xiàn)了性能的突破，解決了很多傳統(tǒng)圖像分析技術(shù)長期無法解決的問題，有力助推了當(dāng)代生命科學(xué)的進(jìn)展。在本次報告中，我將重點聚焦生物光學(xué)顯微圖像的計算分析，通過實例簡要介紹相關(guān)的主要技術(shù)及其在回答基礎(chǔ)生命科學(xué)問題，提升生物光學(xué)成像性能，以及輔助藥物研發(fā)中的一些代表性應(yīng)用。報告的最后我將對于未來幾年相關(guān)深度學(xué)習(xí)技術(shù)的發(fā)展做出展望。
  
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锘海學(xué)術(shù)沙龍背景：
 
借助組織透明化技術(shù)和光片熒光顯微技術(shù)的發(fā)展，研究者對生物組織內(nèi)部的結(jié)構(gòu)及生理、病理特征的觀察和分析從2D提升到了3D。透明化三維成像技術(shù)利用深部組織可視化和大數(shù)據(jù)，引領(lǐng)科學(xué)領(lǐng)域革命性的進(jìn)步。
 
針對科學(xué)研究中組織三維成像中的重點和難點，锘海自主搭建一站式科研平臺，提供從“組織透明化/染色”→“平鋪光片顯微鏡3D成像”→“數(shù)據(jù)采集分析處理及存儲”整體解決方案。同時，大力推廣組織透明化及平鋪光片顯微鏡三維成像技術(shù)和應(yīng)用。2022锘海學(xué)術(shù)沙龍系列講座，將邀請國內(nèi)該領(lǐng)域知名專家學(xué)者做特邀學(xué)術(shù)報告，借此為致力于組織三維成像研究者提供一個共享科研成果和前沿技術(shù)，了解學(xué)術(shù)發(fā)展趨勢，拓寬研究思路的機(jī)會。
 
2022學(xué)術(shù)沙龍系列講座由锘海生物科學(xué)儀器（上海）有限公司主辦，锘海專注于高速高分辨率3D熒光顯微成像系統(tǒng)的研發(fā)、生產(chǎn)和服務(wù)，廣泛應(yīng)用于腦科學(xué)、腫瘤學(xué)、藥物研發(fā)、干細(xì)胞研究、組織胚胎學(xué)等各個研究領(lǐng)域。目前已與國內(nèi)外多家高水平實驗室開展合作研究，并獲得高質(zhì)量的成像數(shù)據(jù)。
 
 

锘海LS18平鋪光片顯微鏡
專為透明化樣品設(shè)計的高速高分辨三維熒光顯微鏡成像系統(tǒng)

針對透明化樣品的3D熒光成像，采用與西湖大學(xué)高亮（平鋪光片技術(shù)發(fā)明人）實驗室共同研制的光片顯微鏡Nuohai LS 18，其運用創(chuàng)新的平鋪光片技術(shù)，克服了傳統(tǒng)光片顯微鏡中空間分辨率、光學(xué)層析能力和成像視野大小之間的矛盾，從而獲得均勻高分辨率的3D熒光圖像，廣泛應(yīng)用于腦科學(xué)、腫瘤學(xué)、藥物研發(fā)、干細(xì)胞研究、組織胚胎學(xué)、組織病理診斷等各個領(lǐng)域。

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锘海組織透明化試劑盒
Cat#：NH210701
 
锘海自主研發(fā)的組織透明化試劑盒依托測樣服務(wù)中積累到的豐富而寶貴的經(jīng)驗，對各種透明化方法進(jìn)行測試和比較后對試劑配方進(jìn)行了精心優(yōu)化，使其在組織熒光保護(hù)、樣本形態(tài)維持、降低自發(fā)熒光等方面表現(xiàn)出非常優(yōu)異的性能。能夠輕松實現(xiàn)小鼠腦、心、肝、脾、肺、腎、胃、腸、睪丸、淋巴、胎盤、卵巢等各類組織器官的透明化，適用范圍廣、操作簡便、速度快、效率高，是廣大科研工作者的不二之選。

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锘海一站式科研服務(wù)
讓科研變得更簡單

組織透明化技術(shù)和光片熒光顯微技術(shù)的發(fā)展，使研究者能從宏觀到微觀對生物組織內(nèi)部的結(jié)構(gòu)及生理、病理特征進(jìn)行觀察和功能性分析。锘海生物科學(xué)儀器（上海）有限公司提供完整器官的組織透明化、組織免疫熒光染色、高分辨3D顯微成像以及大數(shù)據(jù)分析一體化服務(wù)，旨在通過精準(zhǔn)、快速、多樣化的一站式科研服務(wù)為每一位生命科學(xué)工作者提供個體化/定制化的解決方案。

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SmartBatch+ 批量組織透明化染色一體機(jī)
用于快速主動式組織透明化染色系統(tǒng)的新型高通量系統(tǒng)
 
SmartBatch+主動式組織透明化及染色一體機(jī)是基于 Lifecanvas公司新研發(fā)的 Clear+透明化系統(tǒng)迭代設(shè)計而成，高度融合原有一代主動式組織透明化SmartClear系統(tǒng)和主動式免疫標(biāo)記SmartLabel系統(tǒng)所有功能，是一臺功能高度集約、高通量的快速主動式透明化染色一體化設(shè)備。現(xiàn)在，您可以在一天內(nèi)實現(xiàn)一次性12個小鼠腦樣本的透明化或免疫標(biāo)記。
 

 
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