BMG多功能酶標(biāo)儀高通量核酸定量解決方案——簡(jiǎn)化二代測(cè)序質(zhì)量管理
Ulrike Bönisch1, Laura Arrigoni, Diana Santacruz, Nadia Kress
1conceptual design, conduction of experiments, writing of application note
Deep Sequencing Facility, Max Planck Institute of Immunobiology and Epigenetics, Stübeweg 51, Freiburg, 79108, Germany
二代測(cè)序(NGS)高速發(fā)展應(yīng)用,在NGS流程中多個(gè)步驟都需進(jìn)行核酸定量對(duì)NGS樣本進(jìn)行質(zhì)量控制(QC),工作量巨大且要求結(jié)果精確,傳統(tǒng)核酸定量標(biāo)準(zhǔn)方法正面臨著巨大的挑戰(zhàn)。
核酸定量法主要分為光吸收檢測(cè)法和熒光檢測(cè)法。相對(duì)光吸收檢測(cè)法,熒光定量法憑借更高的檢測(cè)靈敏度(高于光吸收檢測(cè)法3個(gè)數(shù)量級(jí)),更高的檢測(cè)特異性(特異性識(shí)別雙鏈/單鏈DNA),目前已成為核酸快速精準(zhǔn)定量的首選方法。
針對(duì)雙鏈DNA進(jìn)行少樣品量熒光法核酸定量,一直以來(lái)常用的方法是:結(jié)合Qubit熒光檢測(cè)儀,使用Qubit熒光染料進(jìn)行定量。然而這種檢測(cè)方法,只能單樣品依次檢測(cè),通量明顯受限,并且試劑耗材成本高,顯然無(wú)法滿足高通量的核酸定量檢測(cè)需求。
對(duì)此,德國(guó)BMG多功能酶標(biāo)儀結(jié)合Qubit核酸定量熒光染料光譜特征,在BMG熒光檢測(cè)酶標(biāo)儀中優(yōu)化完善光路檢測(cè)系統(tǒng),使其核酸熒光定量線性度均可達(dá)到R2>0.9999,且均可支持超高靈敏度的核酸定量(線性檢測(cè)范圍50pg/μl-100ng/μl)。同時(shí),BMG這些高性能檢測(cè)方案,均可在96/384孔板中實(shí)現(xiàn),不僅突破了Qubit檢測(cè)通量低的限制,并大大降低了試劑耗材成本(Qubit 200μl檢測(cè)體系VS BMG 96孔板100μl檢測(cè)體系VS BMG 384孔板20μl檢測(cè)體系),為高通量,精準(zhǔn),快速,高效,低成本的核酸定量提供了完美的解決方案。
下圖為BMG FLUOstar omega多功能酶標(biāo)儀進(jìn)行DNA和RNA熒光定量檢測(cè)與Qubit熒光檢測(cè)儀檢測(cè)結(jié)果的比對(duì),BMG FLUOstar omega多功能酶標(biāo)儀在提高檢測(cè)通量的基礎(chǔ)上同時(shí)還能對(duì)樣品進(jìn)行重復(fù)對(duì)照檢測(cè),更加確保結(jié)果的準(zhǔn)確,也非常適合低濃度樣本的檢測(cè)。
下圖為FLUOstar omega和Qubit熒光檢測(cè)儀的RNA檢測(cè)靈敏度比對(duì)
目前,該解決方案已在國(guó)內(nèi)外實(shí)驗(yàn)室廣泛成熟應(yīng)用起來(lái)。如國(guó)內(nèi)NGS企業(yè)的典型代表-華大基因,目前已為其全部NGS合作實(shí)驗(yàn)室引進(jìn)了三十多臺(tái)BMG多功能酶標(biāo)儀,建立了高通量核酸精準(zhǔn)定量的新標(biāo)準(zhǔn)。
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