北京蛋白質(zhì)組研究中心第五期蛋白質(zhì)組學(xué)培訓(xùn)班通知
北京蛋白質(zhì)組研究中心
第五期蛋白質(zhì)組信息學(xué)培訓(xùn)班
第五期蛋白質(zhì)組信息學(xué)培訓(xùn)班
（第一輪通知）
時(shí)間：2016年8月2-5日
地點(diǎn)：北京蛋白質(zhì)組研究中心（北京市昌平區(qū)科學(xué)園路38號(hào)，中關(guān)村生命科學(xué)園內(nèi)）
主辦單位
國(guó)家蛋白質(zhì)科學(xué)中心·北京(鳳凰中心)
北京蛋白質(zhì)組研究中心（BPRC）
蛋白質(zhì)組學(xué)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室（SKLP）
中國(guó)生物化學(xué)與分子生物學(xué)會(huì)蛋白質(zhì)組學(xué)專業(yè)委員會(huì)（CNHUPO）
國(guó)家蛋白質(zhì)科學(xué)中心•北京（簡(jiǎn)稱“鳳凰中心”）/北京蛋白質(zhì)組研究中心（BPRC）坐落在國(guó)家科技創(chuàng)新示范區(qū)——中關(guān)村生命科學(xué)園，是我國(guó)生命科學(xué)領(lǐng)域的國(guó)家科技基礎(chǔ)設(shè)施，也是國(guó)際人類肝臟蛋白質(zhì)組計(jì)劃執(zhí)行總部、蛋白質(zhì)組學(xué)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室和首都科技條件平臺(tái)。
鳳凰中心/BPRC在以院士領(lǐng)銜，入選國(guó)家杰青、北京市科技新星為骨干的專家團(tuán)隊(duì)帶領(lǐng)下，在生命科學(xué)領(lǐng)域不斷開拓，建立了高通量、高分辨率、高精度的蛋白質(zhì)組學(xué)，以高性能“天河”超級(jí)計(jì)算機(jī)為核心的生物信息學(xué)，蛋白質(zhì)相互作用，多功能多層次顯微成像，流式分選，模式生物構(gòu)建，抗體藥物篩選等技術(shù)體系與平臺(tái)。我們?cè)概c從事生命科學(xué)研究的有識(shí)之士一起，推動(dòng)生命科學(xué)新發(fā)現(xiàn)、新技術(shù)、新產(chǎn)品的涌現(xiàn)，實(shí)現(xiàn)“創(chuàng)造歷史，引領(lǐng)世界”的夢(mèng)想。
培訓(xùn)目的
本課程為生命科學(xué)研究人員介紹如何合理利用和開發(fā)蛋白質(zhì)生物信息學(xué)資源。課程著眼于實(shí)際數(shù)據(jù)庫(kù)搜索、工具使用、大型數(shù)據(jù)庫(kù)分析、生物學(xué)網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建、可視化和數(shù)據(jù)分析等。采取小班授課，專人指導(dǎo)；理論課與實(shí)踐課相結(jié)合，講師與學(xué)員研討的方式進(jìn)行；精心挑選相應(yīng)的上機(jī)軟件，提供充足的實(shí)際操作機(jī)會(huì)；讓每位學(xué)員學(xué)有所成。
培訓(xùn)對(duì)象
● 從事生命科學(xué)、農(nóng)學(xué)、醫(yī)學(xué)等領(lǐng)域科研工作者和高校教師及研究生
● 迫切希望提升生物信息分析能力的學(xué)者
培訓(xùn)內(nèi)容
質(zhì)譜數(shù)據(jù)深度分析、蛋白質(zhì)注釋及功能分析、蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建及分析、蛋白質(zhì)組研究主題信息服務(wù)和專業(yè)數(shù)據(jù)庫(kù)研發(fā)。
課程安排
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2016年8月2日
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主持人：楊 冬 朱偉民
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主題：蛋白質(zhì)組信息學(xué) 蛋白質(zhì)鑒定
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時(shí)間
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主講人
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培訓(xùn)內(nèi)容
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9:00-10:00
講座
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朱偉民
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● 課程介紹
● 蛋白質(zhì)組學(xué)
● 蛋白質(zhì)組信息學(xué)工作流程
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10:00-10:45
講座
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朱偉民
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工作流原理
● 序列數(shù)據(jù)庫(kù)
● 肽段鑒定
● 蛋白組裝
● 蛋白定量
● 質(zhì)量控制和標(biāo)準(zhǔn)
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10:45-11:00
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茶歇
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11:00-11:45
講座
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楊 冬
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工作流原理
● 翻譯后修飾
● 數(shù)據(jù)挖掘
● 數(shù)據(jù)注釋
● 聚類和其他分析
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11:45-12:30
練習(xí)
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楊 冬
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常用的生物信息數(shù)據(jù)庫(kù)和工具
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12:30-13:30
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午餐
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13:30-14:30
講座
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楊 冬
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Mascot：實(shí)踐中的搜索工具
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14:30-15:15
練習(xí)
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楊 冬
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搜索工具的環(huán)境
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15:15-15:30
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茶歇
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15:30-16:30
講座
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楊 冬
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搜索工具實(shí)際應(yīng)用
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16:30-17:15
講座
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朱偉民
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數(shù)據(jù)依賴采集 (DDA)
● 數(shù)據(jù)非依賴采集(DIA)
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17:15-18:00
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BBQ和墻報(bào)展示
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2016年8月3日
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主持人：朱云平
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主題：定量蛋白質(zhì)組
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時(shí)間
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主講人
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培訓(xùn)內(nèi)容
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9:00-10:00
講座
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常 乘
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標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)：precursor標(biāo)記方法
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10:00-10:45
講座
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常 乘
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標(biāo)定定量蛋白質(zhì)組學(xué)：isobaric 標(biāo)記方法
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10:45-11:00
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茶歇
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11:00-11:45
練習(xí)
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常 乘
馬 潔
馮曉東
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MaxQuant標(biāo)記定量上機(jī)練習(xí)
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11:45-12:30
練習(xí)
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常 乘
馬 潔
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練習(xí)
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12:30-13:30
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午餐
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13:30-14:30
講座
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常 乘
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非標(biāo)定量蛋白質(zhì)組學(xué)
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14:30-15:15
練習(xí)
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常 乘
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差異表達(dá)蛋白的統(tǒng)計(jì)分析
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15:15-15:30
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茶歇
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15:30
講座
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常 乘
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PANDA和PANDA視圖介紹
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16:30
練習(xí)
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常 乘
馬 潔
馮曉東
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PANDA和PANDA視圖
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17:15
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結(jié)束
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2016年8月4日
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主持人：馮晉文
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主題：工作流 數(shù)據(jù)發(fā)布
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時(shí)間
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主講人
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培訓(xùn)內(nèi)容
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9:00
講座
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馮晉文
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TPP(trans proteome pipeline)數(shù)據(jù)分析平臺(tái)介紹
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10:00
練習(xí)
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馮晉文
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● 基于X!Tandem肽段鑒定
● 基于peptide Prophet肽段驗(yàn)證
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10:45-11:00
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茶歇
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11:00
練習(xí)
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馮晉文
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蛋白質(zhì)定量
● Libra
蛋白質(zhì)組裝
● Protein Prophet
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11:45
練習(xí)
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馮晉文
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實(shí)際操作
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12:30-13:30
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午餐
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13:30
講座
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馮晉文
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Firmiana簡(jiǎn)介
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14:30
練習(xí)
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馮晉文
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Firmiana上機(jī)練習(xí)
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15:15-15:30
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茶歇
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15:30
講座
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Henning Hermjakob
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數(shù)據(jù)存儲(chǔ)與發(fā)布：ProteomeXchange
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16:30
練習(xí)
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馬 潔
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實(shí)際操作：基于Iprox的數(shù)據(jù)存儲(chǔ)
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17:15-18:00
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參觀Phoenix center
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2016年8月5日
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主持人：李棟
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主題：網(wǎng)絡(luò)和通路
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時(shí)間
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主講人
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培訓(xùn)內(nèi)容
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9:00
講座
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李 棟
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蛋白質(zhì)網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建與分析
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10:00
講座
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李 棟
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蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)集深度挖掘
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10:45
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茶歇
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11:00
練習(xí)
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李 棟
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網(wǎng)絡(luò)工具介紹：
● KEGG, Reactome
● STRING
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11:45
練習(xí)
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李 棟
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上機(jī)練習(xí)
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12:30
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午餐
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13:30
講座
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劉中揚(yáng)
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Cytoscape簡(jiǎn)介
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14:30
練習(xí)
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劉中揚(yáng)
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Cytoscape上機(jī)練習(xí)
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15:15-15:30
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茶歇
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15:30－16:30
練習(xí)
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劉中揚(yáng)
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Cytoscape上機(jī)練習(xí)
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17:15
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結(jié)束
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培訓(xùn)費(fèi)用
● 即日起至8月1日之間注冊(cè)：每人4500元，學(xué)生4000元。
● 網(wǎng)上注冊(cè)地址：（見下方二維碼）
● 培訓(xùn)費(fèi)用包含：培訓(xùn)資料、培訓(xùn)期間的午、晚餐。
● 可協(xié)助安排住宿，住宿費(fèi)用自理。需住宿的學(xué)員請(qǐng)?jiān)诰W(wǎng)上注冊(cè)時(shí)填寫住宿信息。
報(bào)到時(shí)間和地點(diǎn)
● 報(bào)到：8月1日全天，鳳凰中心/BPRC
● 培訓(xùn)：8月2-5日，鳳凰中心/BPRC （北京市昌平區(qū)科學(xué)園路38號(hào)，中關(guān)村生命科學(xué)園內(nèi)）。
● 住宿：北京梧桐苑商務(wù)酒店，預(yù)訂電話：010-61777200（預(yù)定時(shí)請(qǐng)說明參加此次會(huì)議）
注意事項(xiàng)
參加本期培訓(xùn)班的學(xué)員可以享受中心提供的技術(shù)服務(wù)優(yōu)惠政策。技術(shù)服務(wù)項(xiàng)目請(qǐng)看網(wǎng)站：http://www.bprc.ac.cn/guidance/list.php?catid=27或http://www.ncpsb.org/cn/%E6%9C%8D%E5%8A%A1
匯款信息
帳號(hào)：0200004909200041055
賬戶名稱：北京蛋白質(zhì)組研究中心
開戶銀行：工商銀行北京市永定路支行
注：匯款時(shí)請(qǐng)務(wù)必注明學(xué)員姓名、單位和“信息學(xué)培訓(xùn)班”字樣。匯款后將匯款憑據(jù)傳真至中心，或?qū)呙桦娮影姘l(fā)送至郵箱[email protected]，以確保匯款安全到賬。
如需發(fā)票請(qǐng)注明發(fā)票抬頭，培訓(xùn)結(jié)束后統(tǒng)一開具發(fā)票（培訓(xùn)費(fèi)、注冊(cè)費(fèi)、會(huì)議費(fèi)、技術(shù)服務(wù)費(fèi)等），有其他特殊要求請(qǐng)聲明。
聯(lián)系方式
聯(lián)系電話：
注冊(cè)：（010）61777015
咨詢：（010）61777010
傳真：（010）61777050
電子郵件：[email protected]
通信地址：北京市昌平區(qū)科學(xué)園路38號(hào)（102206）
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