Illumina升級BaseSpace Onsite 簡化基因組數(shù)據(jù)共享和分析
瀏覽次數(shù):7288 發(fā)布日期:2015-7-21
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新版本支持NextSeq 500和HiSeq 2500,包括更加多樣化的分析工具集
Illumina近日推出了新版本的BaseSpace OnSite,讓研究人員能夠現(xiàn)場存儲(chǔ)、分析和共享數(shù)據(jù)。對于那些希望享受到云端BaseSpace環(huán)境的多個(gè)功能,但又有著特殊的存儲(chǔ)、網(wǎng)絡(luò)帶寬、安全或監(jiān)管要求的實(shí)驗(yàn)室而言,這個(gè)新工具簡化了基因組數(shù)據(jù)的共享和分析。
通過BaseSpace Onsite 2.0,用戶能夠傳送NextSeq 500和HiSeq 2500測序系統(tǒng)的數(shù)據(jù),并將訪問一個(gè)較新、本地版本的BaseSpace環(huán)境。除了無縫傳送這兩個(gè)Illumina測序平臺(tái)的數(shù)據(jù),用戶也可以導(dǎo)入單個(gè)樣品、變異,以及高達(dá)25 Gb的清單數(shù)據(jù)文件,讓用戶能夠分析不是直接從儀器傳送到BaseSpace Onsite的數(shù)據(jù)。
軟件升級讓BaseSpace Onsite的客戶能夠訪問比之前的配置多一倍的應(yīng)用程序。這些新的應(yīng)用程序?yàn)檠芯咳藛T提供了比對、擴(kuò)增子測序、定制富集、靶向外顯子組、長片段及分相的分析工具,以及與癌癥和微生物學(xué)研究人員明確相關(guān)的應(yīng)用程序。
“我們期望新版本的BaseSpace Onsite為有著特定數(shù)據(jù)要求的實(shí)驗(yàn)室?guī)砀嗟撵`活性,他們希望在基礎(chǔ)和轉(zhuǎn)化研究的新應(yīng)用中使用一流的分析工具,”Illumina企業(yè)信息學(xué)業(yè)務(wù)的市場經(jīng)理Raymond Tecotzky談道�!半S著BaseSpace生態(tài)系統(tǒng)的建立,我們要確保所有的客戶都能訪問我們易用的應(yīng)用程序目錄�!�
BaseSpace Onsite 2.0允許短期存儲(chǔ)高達(dá)9 TB的基因組數(shù)據(jù),也包括長期存儲(chǔ)的存檔功能和刪除功能。
“BaseSpace Onsite的演變是Illumina為我們的客戶提供無縫流程方案中的一部分,這個(gè)方案能解決他們在處理基因組數(shù)據(jù)時(shí)提出的大部分問題,”企業(yè)信息學(xué)業(yè)務(wù)的高級總監(jiān)Brady Davis說�!巴ㄟ^增加平臺(tái)的功能,Illumina讓更多客戶能更輕松地獲取BaseSpace的存儲(chǔ)和分析功能。這個(gè)工具讓客戶從現(xiàn)場的數(shù)據(jù)分析配置平穩(wěn)過渡到云端,反之亦然,這有助于實(shí)現(xiàn)更多的基因組探索和創(chuàng)新。”
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