晶能生物隆重推出鏈特異性轉(zhuǎn)錄組測序秋季大促銷
瀏覽次數(shù):4046 發(fā)布日期:2014-8-22
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晶能生物隆重推出:鏈特異性轉(zhuǎn)錄組測序秋季大促銷!4200元/sample
促銷時間:2014.9.1-2014.9.30
技術(shù)簡介
鏈特異性轉(zhuǎn)錄組測序(strand-specific RNA sequencing)是指在構(gòu)建測序文庫時,利用Illumina高保真Taq酶將mRNA鏈的方向信息保存到測序文庫中。測序后的數(shù)據(jù)分析可確定轉(zhuǎn)錄本是來自正義還是反義DNA鏈。與普通轉(zhuǎn)錄組測序相比,它更能準(zhǔn)確地統(tǒng)計轉(zhuǎn)錄本的數(shù)量和確定基因的結(jié)構(gòu),同時可以發(fā)現(xiàn)更多的反義轉(zhuǎn)錄本,目前被廣泛地應(yīng)用于研究基因結(jié)構(gòu)和基因表達(dá)調(diào)控等領(lǐng)域范圍。
技術(shù)優(yōu)勢:
1.精確度高:文庫制備和測序過程中保留了RNA方向信息,有效數(shù)據(jù)增多,從而使基因表達(dá)定量更加準(zhǔn)確。與基因組和參考基因組的比對結(jié)果,其鏈特異的結(jié)果均相近或稍高于非特異性結(jié)果。
2.豐富度高:準(zhǔn)確發(fā)現(xiàn)反義轉(zhuǎn)錄本,獲取更多轉(zhuǎn)錄本相關(guān)信息,進(jìn)行鑒定分析。
應(yīng)用方向
1. 模式生物基因結(jié)構(gòu)分析:
模式生物已經(jīng)有完整的基因注釋信息,但是實(shí)際研究中存在個體差異性。利用鏈特異性轉(zhuǎn)錄組測序可以對個體表達(dá)基因的結(jié)構(gòu)進(jìn)行深度分析,對基因進(jìn)行重注釋。
2. 差異基因準(zhǔn)確分析:
能針對不同轉(zhuǎn)錄方向的基因進(jìn)行精確的表達(dá)量統(tǒng)計及差異表達(dá)分析,從而推斷出與功能狀態(tài)變化相關(guān)聯(lián)的候選基因,揭示差異基因的功能分類和相關(guān)代謝通路。
3. 原核生物操縱子分析:
對原核生物的鏈特異性轉(zhuǎn)錄組分析,能更加準(zhǔn)確地進(jìn)行操縱子鑒定和分析。
技術(shù)路線
生物信息學(xué)分析
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