液滴微流體助艾滋病毒感染-潛在文庫的轉錄組測序
瀏覽次數(shù):1212 發(fā)布日期:2023-4-23
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DoBio Webinar:液滴微流體方法輔助完成艾滋病毒感染“潛在文庫”的轉錄組測序
Eli Boritz,醫(yī)學博士,
美國國立衛(wèi)生研究院(NIH)病毒持久性和動態(tài)科(VPDS)主任
我們很榮幸地請到Eli Boritz博士作為本次線上研討會的演講者。
Boritz博士和他的團隊最近在《自然》雜志上發(fā)表了一篇論文,重點介紹了他們應用一種基于RNA或DNA生物標志物的新方法來分類和分析細胞類型亞群。研究小組使用這種方法研究了抗逆轉錄病毒治療下艾滋病毒持久性的機制,特別是艾滋病毒感染的記憶CD4 T細胞的表達譜。
該方法被稱為細胞水平的核酸檢測和測序分析(Focused Interrogation of cells by Nucleic acid Detection and Sequencing , FIND-seq),包括通過目標核酸(本研究中的HIV)識別細胞,并將其分類用于單細胞級別的轉錄組分析。研究人員利用微流體技術制備瓊脂糖凝膠珠包封單個細胞的遺傳物質,并根據(jù)HIV核酸標記物的熒光信號對瓊脂糖珠進行分類。細胞的整個轉錄組被保留在瓊脂糖珠內之后可以通過測序進行進一步分析。
研究結果表明,接受抗逆轉錄病毒治療的人的HIV DNA+記憶CD4 T細胞的轉錄組顯示出一個特有的性質,其宿主基因表達模式有利于HIV沉默、細胞存活和細胞增殖,這對HIV治愈策略的發(fā)展具有重要意義。
歡迎加入我們即將舉行的線上研討會,從Boritz博士那里了解更多關于FIND-seq以及艾滋病毒如何在抗逆轉錄病毒治療期間持續(xù)存在的最新進展。
- 一種由RNA或DNA生物標記物定義的RNA測序細胞亞群的新方法
- FIND-seq在研究hiv感染記憶CD4 T細胞轉錄組中的應用
- 抗逆轉錄病毒療法(ART)下艾滋病毒持續(xù)機制的發(fā)現(xiàn)
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