腫瘤免疫浸潤相關(guān)數(shù)據(jù)庫和工具使用技能實戰(zhàn)課通知
瀏覽次數(shù):3573 發(fā)布日期:2021-11-24
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國自然研究熱點腫瘤免疫浸潤相關(guān)數(shù)據(jù)庫和工具使用-生信技能實戰(zhàn)課
時間:2021/12.18-12.19
線上直播,贈送回放視頻,長期答疑群
近期“腫瘤微環(huán)境、免疫浸潤分析”相關(guān)研究不僅在論文發(fā)表上,發(fā)表數(shù)量逐年遞增。從近年的國家自然科學基金資助的項目數(shù)和總金額來看,腫瘤微環(huán)境和免疫方向相關(guān)立項也是節(jié)節(jié)攀升,反映了這一研究領(lǐng)域的重要性。
腫瘤微環(huán)境主要由腫瘤細胞、成纖維細胞、免疫細胞、各種信號分子和細胞外基質(zhì)及特殊的理化特征等共同組成,腫瘤微環(huán)境顯著影響著腫瘤的診斷、生存結(jié)局和臨床治療敏感性。
通過發(fā)揮促腫瘤作用和抗腫瘤作用,浸潤腫瘤的免疫細胞可以深刻影響腫瘤的進展以及抗癌治療的成功。因此,腫瘤浸潤免疫細胞的量化有望揭示免疫系統(tǒng)在人類癌癥中的多方面作用,并參與腫瘤逃逸機制和對治療的反應(yīng)。
因此免疫浸潤也是近幾年腫瘤研究的一個重要方向。目前也有一些比較方便的工具幫助大家挖掘免疫浸潤,如CIBERSORT等。
那么到底熱門文獻中免疫浸潤分析是什么樣的?我們自己能不能做得出來?免疫浸潤分析的相關(guān)工具和數(shù)據(jù)庫到底有哪些,又該如何使用?
華斯泰、爾云主辦的《腫瘤微環(huán)境和免疫浸潤分析-生信技能課程》將帶領(lǐng)大家逐一對相關(guān)的工具和數(shù)據(jù)庫進行學習,希望大家學習之后對免疫浸潤分析有更深刻的了解,基本能夠滿足論文和基金中對于免疫浸潤分析的需求。
一、學習目的與預期
1、主流免疫浸潤分析數(shù)據(jù)庫(IMMUPORT、TISIDB、TIMER等)的熟悉掌握。
2、主流免疫浸潤分析工具(CIBERSORT、ESTIMATE、xCELL等)的熟悉掌握。
3、掌握復現(xiàn)高分文獻中免疫浸潤相關(guān)展示圖表的能力。
4、能夠滿足日常文章以及國自然基金免疫浸潤分析相關(guān)圖表的制作。
二、導師介紹
宋老師,從事生信分析工作多年,參與并完成了超過百個軟件著作權(quán)和發(fā)明專利的撰寫和申請,參與超過近三百個項目的設(shè)計、開發(fā)、分析環(huán)節(jié)。
研究方向:擅長GEO、TCGA數(shù)據(jù)挖掘;轉(zhuǎn)錄組、代謝組,蛋白組,16S等二代測序標準分析和定制化高級分析;長期專注于腫瘤方向生物信息數(shù)據(jù)分析,精通R語言以及各類生物信息學軟件。
主要培訓方向:《GEO數(shù)據(jù)挖掘》、《TCGA數(shù)據(jù)庫挖掘和應(yīng)用》、《網(wǎng)絡(luò)藥理學分析》、《腸道微生物相關(guān)分析》等。
三、會議安排
時間安排 |
主要內(nèi)容 |
第一天 |
9:00~10:10 |
腫瘤免疫浸潤高分生信文獻梳理
免疫浸潤知識介紹并梳理文獻的關(guān)鍵圖表 |
10:20~11:30 |
實操課∶
1、TISIDB免疫學數(shù)據(jù)庫的介紹和使用
2、IMMUPORT免疫數(shù)據(jù)庫的介紹和使用 |
14:00~15:10 |
實操課∶免疫細胞浸潤估計工具CIBERSORT實操(包括原理,數(shù)據(jù)準備,實操,結(jié)果可視化以及結(jié)果解讀) |
15:20~16:30 |
實操課∶ssGSEA 樣本基因集富集分析實操(原理,數(shù)據(jù)準備,操作和結(jié)果解讀) |
第二天 |
9:00~10:10 |
實操課∶腫瘤免疫工具 TIMER的實操以及結(jié)果解讀 |
10:20~11:30 |
實操課∶腫瘤純度算法工具ESTIMATE的實操以及結(jié)果解讀 |
14:00~15:10 |
實操課∶
1、腫瘤免疫浸潤分析工具 EPIC 使用
2、腫瘤免疫浸潤分析工具xCE 使用 |
15:20~16:30 |
課程成果檢測∶3-5分左右純生信文獻涉及免疫浸潤部分的結(jié)果復現(xiàn)實操。提供整理數(shù)據(jù) |
四、培訓相關(guān)
開班時間:2021年12月18-19日
開班地點:線上直播
主辦方:華斯泰科研培訓中心
承辦方:華斯泰生物醫(yī)學科技有限公司
報名費:3200/人(可開具發(fā)票,費用包含電子版材料)
優(yōu)惠政策:
1、提前報名及轉(zhuǎn)賬的,可以提前拿到學習材料
2、兩人成團報名,每人減100
3、三人成團報名,每人減200
4、參與培訓的老師,課程結(jié)束后可以獲得全套視頻
報名咨詢:
聯(lián)系人:李老師
手 機:13366403928(微信同號)
E-mail:
13366403928@163.com
報名方式:
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