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                                                              English | 中文版 | 手機版 企業(yè)登錄 | 個人登錄 | 郵件訂閱
                                                              當前位置 > 首頁 > 行業(yè)資訊 > 講座 > SBC單細胞轉錄組測序及生信分析培訓班報名通知

                                                              SBC單細胞轉錄組測序及生信分析培訓班報名通知

                                                              瀏覽次數(shù):11459 發(fā)布日期:2019-9-27  來源:本站 本站原創(chuàng),轉載請注明出處

                                                               
                                                              自今年6月第一期單細胞轉錄組測序及生信分析培訓班成功舉辦以來,陸續(xù)收到新用戶詢問單細胞測序的培訓課程,結合第一期學員的反饋和建議,SBC茲定于2019年10月24日-26再次舉辦第二期進階版的單細胞轉錄組測序及生信分析培訓班。針對學員們的不同需求,本次培訓班為期三天,包含基礎課程(第1天)及進階課程(第2-3天)兩部分。
                                                               
                                                              課程內容涵蓋10Xgenomic單細胞測序原理、樣本準備、分析流程及原理、R語言基礎、高級分析以及實驗設計策略等。本次培訓班特別邀請到上海交通大學系統(tǒng)生物醫(yī)學研究院副研究員鄒欣博士在第三天的課程中授課。
                                                               
                                                              誠摯邀請各位老師報名參加,本次培訓班實行小班制(限額20人)。
                                                               
                                                              主辦單位:上海生物芯片有限公司/生物芯片上海國家工程研究中心
                                                              培訓日期:2019年10月24日-26日
                                                              培訓地點:上海市浦東新區(qū)張江高科技園區(qū)李冰路151號1號樓
                                                               
                                                              一、 日程安排(暫定)
                                                               
                                                              日期
                                                              時間
                                                              主題
                                                              課程內容
                                                               
                                                              10月24
                                                              第一天
                                                              08:45-09:00
                                                              簽到、領取資料
                                                              09:00-09:10
                                                              開課致辭
                                                              09:10-10:00
                                                              非編碼RNA研究概述及數(shù)據(jù)解讀
                                                              10:00-11:00
                                                              R語言基礎
                                                              基本概念:向量、數(shù)組和矩陣、函數(shù);數(shù)據(jù)導入、編輯、數(shù)據(jù)結構轉換;文件圖表生成、導出
                                                              11:10-11:40
                                                              R語言進階:統(tǒng)計檢驗,差異基因計算
                                                              13:00-14:00
                                                              ggplot2詳解(柱狀圖、餅圖、boxplot、小提琴圖、密度曲線圖,散點圖,差異基因可視化(火山圖)等)
                                                               
                                                              14:00-14:40
                                                              如何畫非常牛的hclust層次聚類圖
                                                              15:00-15:30
                                                              heatmap詳解&韋恩圖詳解
                                                              15:40-16:40
                                                              GEO數(shù)據(jù)庫詳解及常用文章繪圖(誤差線圖、生存曲線圖、jitterplot)
                                                               
                                                              10月25
                                                              第二天
                                                              08:45-09:00
                                                              簽到、領取資料
                                                              09:00-09:10
                                                              開課致辭
                                                              09:10-09:55
                                                              單細胞測序介紹
                                                              單細胞測序技術的發(fā)展及10Xgenomic單細胞測序原理介紹
                                                              10:00-10:30
                                                              樣本準備
                                                               
                                                              單細胞樣本準備及常見問題
                                                              10:40-11:30
                                                              Demo實驗
                                                              13:10-13:40
                                                              10X單細胞轉錄組分析原理及流程介紹
                                                              13:45-14:00
                                                              10XGenomoics 單細胞轉錄組數(shù)據(jù)分析介紹與上機實操
                                                              Cellranger運行環(huán)境、服務器配置,如何從fastq生成表達矩陣等系列結果; Loupe Cell Browser軟件使用
                                                              14:05-15:40
                                                              單細胞轉錄組數(shù)據(jù)多樣本比較分析介紹與上機實操
                                                              使用Seurat進行全套單細胞轉錄組數(shù)據(jù)分析演練:常見7類分析圖:DimPlot_Integret、DotPlot、FeaturePlot整合圖等的代碼解析
                                                              15:45-16:15
                                                              單細胞轉錄組結果報告解讀
                                                              16:20-17:00
                                                              10X單細胞ATAC-seq分析流程及原理介紹
                                                              CellRanger-ATAC運行、運行過程中使用算法介紹及結果解讀; Loupe Cell Browser軟件運行、ChIPseeker對peaks結果注釋、Cicero介紹
                                                              10月26
                                                              第三天
                                                              09:00-09:40
                                                              單細胞ATAC結果報告解讀
                                                              09:55-11:30
                                                              單細胞數(shù)據(jù)中的噪聲干擾以及解決方案
                                                              特邀嘉賓:上海交通大學副研究員鄒欣博士
                                                              13:00-14:00
                                                              高級分析案例分析;流程演練+實操過程答疑
                                                              1、Monocle的原理算法介紹;2、高分文章案例數(shù)據(jù)集作圖:擬時序分析等
                                                              14:10-15:00
                                                              單細胞RNA測序數(shù)據(jù)的聚類工具比較介紹
                                                              聚類方法比較(包括Seurat、Cell Ranger、SC3、ascend、RaceID)
                                                              15:30-16:30
                                                              單細胞測序技術的應用與實驗設計思路解析
                                                              16:30-16:40
                                                              頒發(fā)證書、合影
                                                               
                                                              二、費用及優(yōu)惠
                                                               
                                                              1、培訓費用:
                                                               
                                                              培訓課程
                                                              課程時間
                                                              培訓費
                                                              基礎班
                                                              10月24日(共1天)
                                                              1000元/人
                                                              進階班
                                                              10月25日-26日(共2天)
                                                              2000元/人
                                                              實戰(zhàn)班
                                                              10月24日-26日(共3天)
                                                              2800元/人
                                                              注:以上費用包培訓費、資料費、培訓期間午餐費。
                                                               
                                                              2、報名優(yōu)惠:
                                                               
                                                              · 所產生的培訓費用可在后續(xù)訂購SBC服務產品時抵扣等額的合同款項(每份服務合同只能抵扣一人次),有效期至2020年3月31日為止。
                                                              · 團體報名(同一單位2人及以上)享受9折優(yōu)惠價。
                                                              · 以上2項優(yōu)惠條件可同時享受。
                                                               
                                                              三、報名方式:
                                                               
                                                              點擊此處立即報名,或掃碼報名,本次培訓班限額20名,報名截止日期至2019年10月17日,報滿將提前截止。
                                                               

                                                               
                                                              四、交通信息
                                                               
                                                              培訓地點:上海市李冰路151號1號樓
                                                              交通線路:地鐵2號線金科路站或張江高科站換乘公交1090路、1113路李冰路愛迪生路站
                                                               


                                                              五、報名咨詢:
                                                               
                                                              咨詢電話:400-100-2131(周一至周五9:00-17:00);138 1640 6711
                                                              電子郵箱:[email protected]
                                                              相關公司:上海生物芯片有限公司
                                                              聯(lián)系電話:400-100-2131
                                                              E-mail:[email protected]


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