11月,SelectScience發(fā)表社論文章:發(fā)掘二代測序八大最新技術(Explore Eight of The Latest Advances in Next-Generation Sequencing Technology),這篇文章主要對用于二代測序、質(zhì)量控制和全基因組測序方法樣品制備的最新技術和指南進行了歸納總結。
二代測序工作十分繁瑣,要獲得滿意的測序結果,在最初的樣品制備一步就需要嚴格把控,制備測序樣本時的主要目標是盡量減少產(chǎn)生偏向。偏向是指因?qū)嶒炘O計而產(chǎn)生的數(shù)據(jù)系統(tǒng)失真。為了確保精確測序結果,關鍵是確保樣本制備工作流程是無偏且可靠的;然而實際上實驗偏向是不可能消除的,只能通過采取一切可行的工具和技術來降低偏向?qū)ψ罱K分析的影響。
近年來的研究顯示,利用RNA測序分析基因表達譜可以發(fā)現(xiàn)大量的信息。為了實現(xiàn)RNA測序,首先必須獲得高質(zhì)量的總RNA,相對DNA而言,RNA不穩(wěn)定容易產(chǎn)生降解的特性,令RNA的提取和純化成為進行有效RNA測序的關鍵步驟,這要求一款能高效研磨且在研磨過程中能充分保持RNA分子的完整性和生物活性的研磨儀器。同時研究表明,如果細胞不能均勻且完全破碎的話,在接下來的每一步包括RNA提取步驟都會產(chǎn)生實驗偏向。
法國bertin Precellys生物樣品研磨器2000多篇科學實驗指南充分證明能最大程度地保證提取RNA的無偏性和完整性,優(yōu)化測序提取工序。它的高度靈活性和高效率使用戶能夠在大約30秒的時間里就能完全研磨,均質(zhì)或裂解任何類型的動物、人、植物或微生物的軟硬樣品,是理想的測序樣本前處理工具。
SelectScience在該篇社論中指出,科學家們非常關注二代測序的最新技術和應用,并探索著從小鼠全腎和部分腎中制備高質(zhì)量的總RNA樣品用于基因表達分析,因為只有從整個器官中提取總RNA,才能可靠地估計器官中的基因表達水平(因為較小的部分組織部分可能不代表整個器官)。該報道特別介紹了法國Bertin Precellys生物樣本研磨器幫助科學家有效地從腎器官中提取總RNA,從而獲得高質(zhì)量和高完整性的RNA,為RNA測序和基因表達分析做好充分準備。建立了RNA提取的理想方案,并證明Precellys從半個或整個小鼠腎臟中提取RNA非常有效,如下圖所示分析了兩種樣本研磨提取后RNA質(zhì)量和完整性,圖中結果顯示兩種樣本都獲得了非常高質(zhì)量 (RIN>8.8)的RNA。
利用Precellys和 Cryolys Evolution優(yōu)化核酸提取
>>靈活性: 24 x 2mL (或 0.5mL), 12 x 7mL, 6 x 15mL 研磨管和 96 孔板
>>高效性: up to 10 000 rpm ,可研磨任何類型的樣品
>>保護性: Cryolys 冷卻器保護你的生物分子
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