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羅氏與派瑪?shù)细駭y手助您全面提升二代測(cè)序建庫(kù)自動(dòng)化

瀏覽次數(shù):1292 發(fā)布日期:2015-12-7  來(lái)源:本站 本站原創(chuàng),轉(zhuǎn)載請(qǐng)注明出處
 
高通量測(cè)序技術(shù),又稱第二代測(cè)序技術(shù)(Next Generation Sequencing),使科學(xué)家可在一次實(shí)驗(yàn)中對(duì)多個(gè)樣本進(jìn)行多個(gè)基因的測(cè)序,并已成為現(xiàn)今遺傳基因研究領(lǐng)域中主流的實(shí)驗(yàn)手段,對(duì)DNA和RNA樣本提供一個(gè)強(qiáng)大的檢測(cè)工具。在過(guò)去幾年,NGS技術(shù)不斷發(fā)展和改進(jìn)以增加通量和降低成本。試劑廠家羅氏NimbleGen研發(fā)了SeqCapEZ目標(biāo)序列捕獲試劑系列,它可以集中豐富人類核酸內(nèi)的所有外顯子組或特定的基因片段,以減省分析數(shù)據(jù)時(shí)間和提高實(shí)驗(yàn)效率。然而,這種目標(biāo)序列捕獲和富集的手段往往需要大量秏時(shí)和費(fèi)勁的樣本建庫(kù)預(yù)備,一般來(lái)說(shuō)需要一位經(jīng)驗(yàn)豐富的技術(shù)人員花上最少4天去完成48個(gè)樣本建庫(kù)。由于二代測(cè)序?qū)颖居泻芨叩囊,建?kù)過(guò)程中需要有經(jīng)驗(yàn)技術(shù)員高度專注去操作,包括建庫(kù)過(guò)程中樣本和試劑溫度的控制,孵育時(shí)間等等,稍有差池也會(huì)影響測(cè)序給果。
 
由于二代測(cè)序的樣本前處理和建庫(kù)的步驟繁復(fù),很多實(shí)驗(yàn)室想把這過(guò)程自動(dòng)化,以確保準(zhǔn)確性和實(shí)驗(yàn)成功率。有見及此,NGS試劑廠家羅氏NimbelGen與法國(guó)移液工作站廠家PrimaDiag(派瑪?shù)细瘢┕餐诜▏?guó)簽訂合作協(xié)議,在派瑪?shù)细竦腁CSIA工作站平臺(tái)上研發(fā)了NGSCapture系統(tǒng)來(lái)提供解決方案。ACSIA工作站擁有多個(gè)最新的技術(shù),包括專利的自動(dòng)磁化磁珠捕獲裝置、精準(zhǔn)至0.1℃溫控系統(tǒng)、200rpm至3,000rpm范圍可調(diào)的振蕩器,使它可優(yōu)化所有磁珠法的實(shí)驗(yàn)條件。而且,ACISA的操作軟件擁有專利的智能槍頭管理功能(Smart Tip),可自動(dòng)計(jì)算槍頭使用數(shù)量和在沒有交叉感染的情況下重用槍頭,減省實(shí)驗(yàn)成本。為了防止實(shí)驗(yàn)受到外來(lái)的污染,ACSIA更可配備保護(hù)罩、紫外光燈和空氣過(guò)濾系統(tǒng),提供全面的保護(hù)。

ACSIA工作站
 
 
經(jīng)過(guò)優(yōu)化后,ACSIA工作站很完美地利用羅氏SeqCapEZ捕獲建庫(kù)試劑把整個(gè)二代測(cè)序的建庫(kù)過(guò)程自動(dòng)化,與人手相比,ACSIA自動(dòng)化平臺(tái)省卻了4小時(shí)的建庫(kù)時(shí)間,而且,在Smart Tip的功能下,所使用的槍頭比人手少了3倍,由原來(lái)的9盒槍頭減至3盒。在二代測(cè)序結(jié)果方面,ACSIA比人手操作帶來(lái)更穩(wěn)定和更好的測(cè)序效果。ㄒ娤聢D)
二代測(cè)序檢測(cè)中,ACSIA(藍(lán)色)和人手(紅色)預(yù)備樣本中的18個(gè)基因組檢測(cè)覆蓋深度
 
ACSIA多功能工作站是全面的開放式平臺(tái),系統(tǒng)已內(nèi)置對(duì)各大試劑盒的優(yōu)化程序,如Illumina、Roche、Aligent、Kapa Biosystems,等。除了二代測(cè)序樣本制備外,ACSIA還可能進(jìn)行移液分液、核酸提取及純化、PCR樣品制備、質(zhì)譜樣本前處理、單針挑樣等實(shí)驗(yàn),實(shí)在是一臺(tái)多功能的自動(dòng)化平臺(tái)!
 
派瑪?shù)细衽c羅氏合作新聞原稿:PARTNERSHIP WITH ROCHE DIAGNOSTICS FRANCE
更多參考信息:羅氏牽手派瑪?shù)细褚埔汗ぷ髡具M(jìn)軍二代測(cè)序平臺(tái)
相關(guān)公司:廣州雅康醫(yī)療科技有限公司
聯(lián)系電話:13570233575
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