高通量測(cè)序技術(shù),又稱第二代測(cè)序技術(shù)(Next Generation Sequencing),使科學(xué)家可在一次實(shí)驗(yàn)中對(duì)多個(gè)樣本進(jìn)行多個(gè)基因的測(cè)序,并已成為現(xiàn)今遺傳基因研究領(lǐng)域中主流的實(shí)驗(yàn)手段,對(duì)DNA和RNA樣本提供一個(gè)強(qiáng)大的檢測(cè)工具。在過(guò)去幾年,NGS技術(shù)不斷發(fā)展和改進(jìn)以增加通量和降低成本。試劑廠家羅氏NimbleGen研發(fā)了SeqCapEZ目標(biāo)序列捕獲試劑系列,它可以集中豐富人類核酸內(nèi)的所有外顯子組或特定的基因片段,以減省分析數(shù)據(jù)時(shí)間和提高實(shí)驗(yàn)效率。然而,這種目標(biāo)序列捕獲和富集的手段往往需要大量秏時(shí)和費(fèi)勁的樣本建庫(kù)預(yù)備,一般來(lái)說(shuō)需要一位經(jīng)驗(yàn)豐富的技術(shù)人員花上最少4天去完成48個(gè)樣本建庫(kù)。由于二代測(cè)序?qū)颖居泻芨叩囊,建?kù)過(guò)程中需要有經(jīng)驗(yàn)技術(shù)員高度專注去操作,包括建庫(kù)過(guò)程中樣本和試劑溫度的控制,孵育時(shí)間等等,稍有差池也會(huì)影響測(cè)序給果。 | |||
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經(jīng)過(guò)優(yōu)化后,ACSIA工作站很完美地利用羅氏SeqCapEZ捕獲建庫(kù)試劑把整個(gè)二代測(cè)序的建庫(kù)過(guò)程自動(dòng)化,與人手相比,ACSIA自動(dòng)化平臺(tái)省卻了4小時(shí)的建庫(kù)時(shí)間,而且,在Smart Tip的功能下,所使用的槍頭比人手少了3倍,由原來(lái)的9盒槍頭減至3盒。在二代測(cè)序結(jié)果方面,ACSIA比人手操作帶來(lái)更穩(wěn)定和更好的測(cè)序效果。ㄒ娤聢D) | |||
二代測(cè)序檢測(cè)中,ACSIA(藍(lán)色)和人手(紅色)預(yù)備樣本中的18個(gè)基因組檢測(cè)覆蓋深度 | |||
ACSIA多功能工作站是全面的開放式平臺(tái),系統(tǒng)已內(nèi)置對(duì)各大試劑盒的優(yōu)化程序,如Illumina、Roche、Aligent、Kapa Biosystems,等。除了二代測(cè)序樣本制備外,ACSIA還可能進(jìn)行移液分液、核酸提取及純化、PCR樣品制備、質(zhì)譜樣本前處理、單針挑樣等實(shí)驗(yàn),實(shí)在是一臺(tái)多功能的自動(dòng)化平臺(tái)! | |||
派瑪?shù)细衽c羅氏合作新聞原稿:PARTNERSHIP WITH ROCHE DIAGNOSTICS FRANCE | |||
更多參考信息:羅氏牽手派瑪?shù)细褚埔汗ぷ髡具M(jìn)軍二代測(cè)序平臺(tái) |