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吉凱基因應用QIAGEN旗下IPA平臺推出生物信息分析新服務

瀏覽次數(shù):5951 發(fā)布日期:2015-10-29  來源:本站 本站原創(chuàng),轉(zhuǎn)載請注明出處

您是否還在為自己的實驗在開始之初就已經(jīng)發(fā)表而擔心?
您是否還在為一大堆的實驗數(shù)據(jù)不知道該從哪里開始而發(fā)愁?
您是否還在為擁有一個龐大的實驗數(shù)據(jù)集合而不能獲得有效的研究思路而抓狂?
 
 
不用擔心,IPA來了!IPA的來臨,為您帶來了最前沿,最清晰,最可靠的生物信息解決方案,為辛勤工作的您創(chuàng)建了嶄新的科研視野! 

IPA是QIAGEN公司下Ingenuity Pathway Analysis分析平臺, 該平臺是一個基于后臺高度結(jié)構(gòu)化的Ingenuity Knowledge Based的強大數(shù)據(jù)庫。它歷經(jīng)15年的海量投入;擁有500名phD閱讀文獻;對700種權(quán)威雜志全文閱讀,3000種雜志摘要閱讀,它存儲了510萬以上的生物實驗發(fā)現(xiàn)信息,130萬種互作信息,3萬種以上分子信息;它構(gòu)建了完整的功能疾病分類數(shù)據(jù)庫,800種信號通路、代謝通路;與公共數(shù)據(jù)庫進行全面合作,并保持每周更新一次。它為眾多以發(fā)現(xiàn)、創(chuàng)造為己任的科研工作者們提供了及時、準確的生物信息數(shù)據(jù)。


現(xiàn)在,就讓我們以簡單的實例來觸摸IPA的心跳吧! 

當我們獲得了一個藥物的靶點的時候,我們最希望的是我們可以一目了然的知道這個藥物靶標在受到藥物后都發(fā)生了那些變化,影響了哪些功能,影響這些功能可能是通過哪些分子進行相互影響的。那么IPA就可以幫你解決這個問題。IPA中通過對敲減、過表達、或者藥物處理等獲得的差異基因一次進行了多個分析,其中包括了經(jīng)典通絡分析,功能與疾病分析,上游調(diào)控因子分析,調(diào)控效應分析,分析網(wǎng)絡分析。

舉一個簡單的例子:通過IPA對GEO數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)進行分析,我們可以知道,目的基因SRF的敲減,對前列腺癌細胞中的癌癥功能顯著抑制,而細胞生長和增殖,細胞運動,細胞循環(huán)等功能被顯著激活,在被激活的信號通路EIF2 Signaling中的基因參與了細胞凋亡?,在上游調(diào)控分析中我們發(fā)現(xiàn)了SRF基因通過調(diào)控CXCR4等轉(zhuǎn)錄因子影響了細胞侵襲等功能,在調(diào)控分析中我們發(fā)現(xiàn)了RAF1等基因可以通過ATM等基因抑制了惡性腫瘤的發(fā)生,在網(wǎng)絡分析中我們找到了目的基因可能通過FAS基因?qū)毎蛲霎a(chǎn)生抑制作用。更多詳細信息需要根據(jù)不同的實驗需求,通過IPA的分析內(nèi)容進行更為深入的研究。

IPA的作用不僅局限于此,他可以帶著我們在基因表達,microRNA,SNP微陣列的數(shù)據(jù),代謝物組學和蛋白質(zhì)組學的實驗數(shù)據(jù),和一些可產(chǎn)生基因、化學品列表的小規(guī)模實驗的數(shù)據(jù)中,搜索到有關基因、蛋白質(zhì)、化學品和藥物的信息,并能夠為您創(chuàng)建一個實驗系統(tǒng)的交互模型。該軟件已被世界頂尖的制藥公司和科研機構(gòu)廣泛使用,至今引用該軟件發(fā)表的高水平科研文獻已超過3000篇。 

辛勤的科研工作者們都奔走在金光燦爛的星光大道上,您還在等待什么呢?! 

現(xiàn)在,吉凱基因可以為您提供全面的IPA分析服務,如果您有意向,快來聯(lián)系我們吧!


 

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