Cancer Cell:康成客戶中山大學宋爾衛(wèi)組乳腺癌新成果
瀏覽次數(shù):3041 發(fā)布日期:2015-3-16
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中山大學孫逸仙紀念醫(yī)院乳腺腫瘤中心宋爾衛(wèi)教授主要從事乳腺癌的生物學特性及治療學基礎(chǔ)研究,在非編碼RNA調(diào)控腫瘤侵襲轉(zhuǎn)移及靶向?qū)胄》肿覴NA抑制腫瘤轉(zhuǎn)移的研究方面有杰出工作。近期,宋爾衛(wèi)教授課題組利用Arraystar Human LncRNA芯片發(fā)現(xiàn)了能抑制乳腺癌腫瘤轉(zhuǎn)移的新lncRNA分子——NKILA。NKILA能夠與經(jīng)典的NF-kB信號通路相互作用,通過結(jié)合NF-kB/IkB抑制了IKK誘導(dǎo)的IkB磷酸化,使得NF-kB信號通路失活,從而抑制乳腺癌腫瘤轉(zhuǎn)移。該研究成果刊登在國際頂級期刊Cancer Cell(影響因子23.893)。(芯片實驗由康成提供技術(shù)服務(wù))
研究背景
NF-kB是一個在炎癥、免疫、細胞增殖和細胞分化等過程中發(fā)揮關(guān)鍵作用的轉(zhuǎn)錄因子。NF-kB是聯(lián)系炎癥與腫瘤的關(guān)鍵分子,炎癥條件下,NF-kB組成性持續(xù)激活,促進腫瘤細胞侵襲和轉(zhuǎn)移。lncRNAs是一類轉(zhuǎn)錄本長度超過200nt的RNA分子,無蛋白質(zhì)編碼功能。近來的研究發(fā)現(xiàn),lncRNA在多個層面調(diào)控基因表達,并且能夠調(diào)控腫瘤細胞增殖、凋亡、轉(zhuǎn)移、代謝、衰老和抗藥性。但是lncRNA在NF-kB信號通路和腫瘤相關(guān)的炎癥反應(yīng)中的作用尚不清楚。宋爾衛(wèi)教授課題組本次研究目的在于揭示lncRNA與NF-kB信號通路及乳腺癌腫瘤轉(zhuǎn)移間的關(guān)系。
研究思路
研究表明,炎癥因子能夠激活乳腺癌細胞中的NF-kB信號通路。作者利用Arraystar Human LncRNA芯片檢測多種炎癥因子((TNF)-a, IL-1b 和LPS)處理的乳腺癌細胞(MDA-MB-231)。與PBS處理的對照組比較,炎癥因子處理的乳腺癌細胞中分別有23個上調(diào)10倍的lncRNAs和28個下調(diào)10倍的lncRNAs。其中,NKILA在三組炎癥因子處理中均上調(diào)12倍以上,并且Northern blot和RT-PCR證實NKILA在炎癥因子處理的乳腺癌細胞中顯著增加。作者隨后利用一系列生物學手段對NKILA的特征進行揭示:5’-和3’-RACE實驗獲得NKILA全長序列;序列分析顯示NKILA不具有編碼蛋白質(zhì)的能力;熒光原位雜交(FISH)結(jié)合共聚焦實驗顯示NKILA主要定位于細胞質(zhì),并通過核質(zhì)分離實驗得到驗證。
對于NKILA的功能,體外細胞實驗顯示,在乳腺癌細胞中NKILA能夠顯著促進細胞凋亡,抑制腫瘤細胞侵襲,這與NF-kB抑制細胞凋亡、促進腫瘤侵襲的功能相反。體內(nèi)動物實驗顯示,對于異種移植乳腺癌細胞的小鼠模型,過表達NKILA能夠降低NF-kB活性,抑制腫瘤轉(zhuǎn)移,小鼠生存時間長;反之,沉默NKILA能夠增加NF-kB活性,促進腫瘤轉(zhuǎn)移,小鼠生存時間短。
為了研究NKILA與NF-kB信號通路的關(guān)系,作者分別利用RNA-IP、RNA pull-down、RNA EMSA、蛋白-RNA結(jié)構(gòu)分析、熒光素酶報告基因、ChIP和EMSA等實驗進行探索。數(shù)據(jù)表明NF-kB能夠結(jié)合NKILA啟動子,促進NKILA基因表達。在轉(zhuǎn)移性乳腺癌中高表達的miR-103/-107能夠快速降解NKILA,抵消NF-kB對NKILA的促進作用。同時,作者發(fā)現(xiàn)NKILA可結(jié)合NF-kB/IkB形成穩(wěn)定的復(fù)合物,并直接遮蓋IkB的磷酸化motif,由此抑制了IKK誘導(dǎo)的IkB磷酸化以及NF-kB激活,形成負反饋。
作者進一步利用多達上千例的乳腺癌臨床標本研究NKILA的臨床意義。原位雜交實驗顯示,NKILA在癌旁組織中高表達,在低轉(zhuǎn)移的乳腺癌組織中表達降低,在高轉(zhuǎn)移的乳腺癌組織中表達水平最低。RT-PCR結(jié)合生存曲線表明,高表達的NKILA與乳腺癌患者的不良預(yù)后密切相關(guān),可以作為潛在的乳腺癌預(yù)后生物標記物。
結(jié)果展示
圖A. RT-PCR驗證結(jié)果顯示NKILA在三種炎癥因子處理的乳腺癌細胞中表達水平顯著升高,與芯片數(shù)據(jù)相符;
圖B. RT-PCR結(jié)合預(yù)后K-M曲線,顯示NKILA高表達與乳腺癌預(yù)后不良密切相關(guān);
圖C. 圖示miR-103/-107與NKILA的結(jié)合位點,熒光素酶報告基因?qū)嶒灤_認miR-103/-107調(diào)控NKILA表達水平。
圖D. 模型展示:在轉(zhuǎn)移性乳腺癌中,NF-kB活性高,促進NKILA表達;而在轉(zhuǎn)移性乳腺癌中高表達的miR-103/-107能夠快速降解NKILA,抵消NF-kB對NKILA的促進作用。
研究意義
該研究首次揭示了lncRNA與NF-kB信號通路的關(guān)系。轉(zhuǎn)錄因子NF-kB通過結(jié)合NKILA啟動子,促進NKILA基因表達。在轉(zhuǎn)移性乳腺癌中高表達的miR-103/-107能夠快速降解NKILA,抵消NF-kB對NKILA的促進作用。大量實驗表明NKILA可結(jié)合NF-kB/IkB形成穩(wěn)定的復(fù)合物,并直接遮蓋IkB的磷酸化motif,由此抑制了IKK誘導(dǎo)的IkB磷酸化以及NF-kB激活,形成負反饋。在炎癥條件下,NKILA對于阻止NF-kB信號通路在乳腺細胞中的過度激活起到關(guān)鍵作用。同時,大量乳腺癌臨床標本的研究表明,高表達的NKILA與乳腺癌患者的不良預(yù)后密切相關(guān)。這些研究提供了乳腺癌的潛在治療靶點和預(yù)后生物標記物。
原文出處
A Cytoplasmic NF-kB Interacting Long Noncoding RNA Blocks IkB Phosphorylation and Suppresses Breast Cancer Metastasis. Cancer Cell, 2015, 27, 370–381.
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