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轉(zhuǎn)錄組研究策略及RNA-seq數(shù)據(jù)分析6月專題培訓(xùn)班通知

瀏覽次數(shù)：3441　發(fā)布日期：2014-6-5　來源：本站　本站原創(chuàng)，轉(zhuǎn)載請注明出處

轉(zhuǎn)錄組研究策略及RNA-seq數(shù)據(jù)分析專題強化培訓(xùn)班

2014年6月15日-20日，中國·青島

轉(zhuǎn)錄組研究策略及RNA-seq數(shù)據(jù)分析專題強化培訓(xùn)班將于2014年06月15日-20日在青島大學(xué)國際學(xué)術(shù)交流中心舉辦。本期培訓(xùn)班以第二代測序、第三代測序（單分子測序）在轉(zhuǎn)錄組學(xué)中的應(yīng)用與RNA-seq數(shù)據(jù)分析為主題，精心設(shè)計了具有前沿性、實用性和針對性強的理論課程和上機課程。理論課程由擔(dān)任國家973計劃（轉(zhuǎn)錄組方向）首席科學(xué)家、國家自然科學(xué)基金重點專項負(fù)責(zé)人于軍、胡松年等多位研究員親自授課，上機課程由實踐經(jīng)驗豐富的一線科研人員帶領(lǐng)學(xué)員親自實踐RNA-seq數(shù)據(jù)分析流程。本班因老師時間的問題一年只舉辦一次，歡迎各領(lǐng)域廣大科研工作者和高校教師及研究生積極報名參加！

主辦單位

北京路思達(dá)生物信息科技有限公司

上�，|瑜生物科技有限公司

承辦單位

上海陳珖文化傳播有限公司

培訓(xùn)時間：2014年6月15日至20日（6月15日報到）

培訓(xùn)地點：青島大學(xué)國際學(xué)術(shù)交流中心

課程安排

時間	課程內(nèi)容	學(xué)時	講師
06月15日（周日）全天	報到、注冊
06月16日（周一） 9:00-12:00	轉(zhuǎn)錄組學(xué)發(fā)展前沿、科研思路及技術(shù)路線	3h	于軍
06月16日（周一） 13:30~16:30	動物轉(zhuǎn)錄組項目研究講解	3h	于軍
06月17日（周二） 9:00-12:00	二代測序、三代測序在轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究中的應(yīng)用	3h	胡松年
06月17日（周二） 13:30~16:30	植物轉(zhuǎn)錄組、微生物轉(zhuǎn)錄組項目研究講解	3h	胡松年
06月18日（周三） 9:00-12:00	二/三代測序儀原理介紹轉(zhuǎn)錄組建庫實驗流程詳解（包括文庫選擇，測序文庫構(gòu)建注意事項）測序文庫試劑的選擇和使用心得等	3h	中科院專家
06月18日（周三） 13:30~16:30	轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析概述與經(jīng)驗交流（1）介紹轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析的整體流程：包括de novo轉(zhuǎn)錄組分析、有基因組reference的轉(zhuǎn)錄組分析、microRNA分析等。（2）轉(zhuǎn)錄組分析經(jīng)驗交流：包括測序量如何選擇；測序質(zhì)量如何評估；如何根據(jù)自己的實際情況選擇mapping/denovo assembly軟件；如何從轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)尋找生物學(xué)問題。 Linux常用基本命令 R語言應(yīng)用簡介	3h（上機）	中科院專家
06月19日（周四） 9:00-12:00	轉(zhuǎn)錄組denovo（無參考序列）測序數(shù)據(jù)拼接及分析：利用trinity實現(xiàn)轉(zhuǎn)錄組denovo組裝，并進行預(yù)測蛋白序列、篩選差異基因及計算表達(dá)量等功能分析的講解。	3h（上機）	中科院專家
06月19日（周四） 13:30~16:30	基于二代RNA-seq的差異基因分析（參照序列）：主要利用tophat和cufflinks,cuffdiff以及cummeRbund 等工具，實現(xiàn)reads的mapping, 轉(zhuǎn)錄本的重構(gòu)，轉(zhuǎn)錄本的表達(dá)量計算，差異基因分析以及利用cummeRbund圖形化展示cuffdiff的分析結(jié)果。GO、KEGG富集等功能分析。	3h（上機）	中科院專家
06月20日（周五） 9:00-12:00	miRNA二代測序數(shù)據(jù)分析 1. miRNA數(shù)據(jù)mapping的原理介紹及軟件使用 2. 靶基因預(yù)測原理介紹及軟件使用 3. miRNA數(shù)據(jù)庫介紹及使用 4. miRNA的功能分析	3h(上機)	中科院專家

相關(guān)事項：

A：注冊費

3600元/人（含培訓(xùn)費、上機費、電子版資料費，培訓(xùn)結(jié)束后免費贈送價值1600元的生物信息云平臺使用權(quán)限（免費開放2周，培訓(xùn)后可繼續(xù)進行鞏固練習(xí)））。

優(yōu)惠政策：

1.5月28日前匯款，注冊費可優(yōu)惠至3400元/人。

2.同一單位三人及以上同時報名注冊費優(yōu)惠至：3300元/人。

3.以上兩種優(yōu)惠不可同時使用。

外地學(xué)員住宿統(tǒng)一安排在青島大學(xué)國際學(xué)術(shù)交流中心，住宿費用自理。酒店標(biāo)準(zhǔn)間價格：300元/間/天，與其他學(xué)員合住標(biāo)準(zhǔn)間價格：150元/間/天，合住按報到先后順序安排，最后出現(xiàn)單數(shù)無法安排情況房間差價費用自理。

6月16日至6月20日會務(wù)組為學(xué)員提供免費工作午餐，培訓(xùn)期間早餐及晚餐自理。

B：付款信息（電匯或轉(zhuǎn)賬）

賬戶名稱：北京路思達(dá)生物信息科技有限公司

賬戶號：321230100100073558

開戶行：興業(yè)銀行海淀支行

轉(zhuǎn)賬或者匯款時請仔細(xì)核對賬戶名稱及賬號，并在匯款用途處注明：姓名

C：聯(lián)系方式

金老師

TEL: 15021364017

E-mail： QQ:348280957

名額有限，按學(xué)員付款先后順序安排上課及上機位置。上機實踐需自帶筆記本電腦，電腦對系統(tǒng)及配置無特殊要求。

報名表