羅氏NimbleGen最新推出CGH ISCA Plus細(xì)胞遺傳學(xué)芯片
瀏覽次數(shù):3513 發(fā)布日期:2012-3-12
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羅氏 NimbleGen 最新推出 CGH ISCA Plus 細(xì)胞遺傳學(xué)芯片
羅氏NimbleGen最新推出針對(duì)細(xì)胞遺傳學(xué)的NimbleGen CGH ISCA Plus細(xì)胞遺傳學(xué)芯片。細(xì)胞遺傳學(xué)研究在發(fā)育異常及腫瘤研究中都占有重要地位,其主要研究?jī)?nèi)容為染色體異,F(xiàn)象,包括拷貝數(shù)改變(Copy Number Variation, CNV)以及雜合性丟失(Loss of Heterozygosity, LOH)。這款新產(chǎn)品擁有420萬(wàn)個(gè)DNA探針,包含有檢測(cè)CNV的CGH探針以及檢測(cè)LOH的SNP探針,可同時(shí)亦高分辨率地檢測(cè)CNV及LOH。不需要任何實(shí)驗(yàn)流程的改變,就可以完成同時(shí)兩種測(cè)試。
該款芯片包含了來(lái)自ISCA,OMIM,Decipher等多個(gè)遺傳性疾病數(shù)據(jù)庫(kù),廣泛的細(xì)胞遺傳學(xué)研究?jī)?nèi)容。
針對(duì)418種的疾病相關(guān)區(qū)域進(jìn)行設(shè)計(jì),包括ISCA,OMIM,Decipher數(shù)據(jù)庫(kù)的4200種基因:
● 含有約50萬(wàn)個(gè)CGH探針,CNV分辨率可達(dá)15-20 Kb
● 通過(guò)64000個(gè)SNP探針檢測(cè)LOH,分辨率達(dá)到5 Mb
● 一張芯片可檢測(cè)多個(gè)樣本,降低實(shí)驗(yàn)成本
在數(shù)據(jù)分析方面, 該產(chǎn)品配有不同的設(shè)計(jì)文件,可以以不同CNV及LOH分辨率解讀芯片實(shí)驗(yàn)結(jié)果,并參照ISCA數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行分析,如ISCA 44k, ISCA 60K,ISCA 105K,ISCA 180K,可以根據(jù)研究需要進(jìn)行選擇。芯片可使用Deva、Nexus Copy Number™ Analysis 軟件進(jìn)行分析,按照不同設(shè)計(jì)文件進(jìn)行數(shù)據(jù)儲(chǔ)存及處理,獲得圖形化的CNV、LOH分析結(jié)果,并可與 Decipher 、ISCA 等數(shù)據(jù)庫(kù)相連,生成細(xì)胞遺傳學(xué)報(bào)告。
該芯片實(shí)驗(yàn)的優(yōu)勢(shì)在于快速、高分辨率地檢測(cè)全基因組水平的染色體異常情況。相比傳統(tǒng)的染色體分型、原位雜交方法,更加高效,同時(shí)還可為每個(gè)樣本選取合適的對(duì)照,如腫瘤組織樣本與正常組織樣本進(jìn)行對(duì)比,出生缺陷兒童的樣本與其正常父母樣本進(jìn)行直接比較。
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http://www.nimblegen.com/products/cgh/isca/index.html