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羅氏NimbleGen芯片幫助鑒別新型基因組疾病的特征

瀏覽次數(shù):6644 發(fā)布日期:2009-7-14  來(lái)源:本站 本站原創(chuàng),轉(zhuǎn)載請(qǐng)注明出處
羅氏NimbleGen 比較基因組雜交(CGH 芯片在近期研究中
幫助鑒別精神疾病相關(guān)的新型基因組疾病的特征
 
高分辨率的比較基因組雜交技術(shù)(CGH)已迅速成為分子細(xì)胞遺傳學(xué)檢測(cè)所選擇的一種方法,并被用來(lái)鑒別與精神發(fā)育遲滯、癌癥和其它復(fù)雜表型相關(guān)的染色體異常的特征。在《醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)雜志》最近公布的兩項(xiàng)研究中,高分辨率的NimbleGen CGH芯片被用來(lái)進(jìn)一步鑒別近期識(shí)別出的兩種基因組疾病的特征。
 
在第一項(xiàng)研究中,van Bon和同僚們采用定制的NimbleGen CGH 12x135K 和 4x72K 芯片,準(zhǔn)確地描繪出了一系列伴有發(fā)育遲緩和正常核型的人體內(nèi)的15q13區(qū)域的染色體斷裂位點(diǎn)。對(duì)15q13.3 微缺失綜合癥的初步鑒定顯示,在類似于Prader Willi綜合癥、Angelman綜合癥和Williams-Beuren綜合癥(3)的弱智患者中經(jīng)常出現(xiàn)這一癥狀。在目前對(duì)其他18人進(jìn)行的隱匿性15q13.3 缺失研究分析顯示,其中至少有11人出現(xiàn)差異較大的家族內(nèi)和家族間疾病特征,且伴有遺傳性缺失。除此之外,在來(lái)自四個(gè)家族的10位兄弟姐妹中,有7人也帶有隱匿性缺失,其疾病特征表現(xiàn)為輕度發(fā)育遲緩、幼兒學(xué)習(xí)障礙和無(wú)可識(shí)別表型的不同癥狀。在對(duì)同一區(qū)域出現(xiàn)重復(fù)綜合癥的4人的分析中,無(wú)法找到共同的可識(shí)別表型,盡管發(fā)現(xiàn)其中2人的精神不正常。有趣的是,在近期對(duì)16名精神分裂癥患者進(jìn)行的一項(xiàng)研究中發(fā)現(xiàn)15q13區(qū)域的染色體缺失,其中1人還患有孤獨(dú)癥。 以上所有這些研究的數(shù)據(jù)都將 15q13.3微缺失綜合癥與各種疾病特征聯(lián)系在一起,包括正常發(fā)育至輕度和重度的精神發(fā)育遲滯和精神疾病,并對(duì)“遺傳自明顯正常的父母的染色體異常通常沒(méi)有臨床意義”的慣常說(shuō)法發(fā)起了挑戰(zhàn)。
 
與染色體17q21.31有關(guān)的第二種新型基因組疾病最近被識(shí)別出來(lái),截止目前,在醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)中公布的17q21.31缺失共有14例。在初步報(bào)告中,定制的NimbleGen CGH芯片被用來(lái)界定一個(gè)最小的臨界 478 kb缺失區(qū)域。在當(dāng)前的研究中,Koolen和同僚們采用一個(gè)定制的 NimbleGen 385K 芯片,準(zhǔn)確地描繪出了其他5位受感染患者中的染色體斷裂位點(diǎn)。該分析的結(jié)果把17q21.31臨界區(qū)域縮小至一個(gè)含有至少6個(gè)基因的424 kb區(qū)域,其中包括與多種神經(jīng)變性疾病有關(guān)的MAPT 基因。此外,NimbleGen CGH芯片在雙親樣本中識(shí)別出了與致病性缺失有關(guān)的特異性多態(tài)。
 
以上所有這些研究的數(shù)據(jù)都把17q21.31微缺失綜合癥確認(rèn)為在臨床上和分子上均可識(shí)別的基因組疾病,在患有無(wú)法解釋的精神發(fā)育遲滯、且大部分尚未診斷出的人群中的發(fā)病頻率為0.64%。
 
上述這些研究說(shuō)明了,NimbleGen CGH芯片憑借獨(dú)具特色的高分辨率與高靈活性的設(shè)計(jì),使新型微缺失綜合癥的識(shí)別和分子特性研究成為可能的,它還使人們認(rèn)識(shí)到了此類綜合癥能代表無(wú)法預(yù)知且差異很大的疾病特征。持續(xù)對(duì)微缺失和重復(fù)綜合癥的識(shí)別與特征描述進(jìn)行研究對(duì)建立起臨床診斷標(biāo)準(zhǔn)是至關(guān)重要的。


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