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網(wǎng)絡式大數(shù)據(jù)構(gòu)建“藥物Google搜索工具”揭示藥物與疾病之間聯(lián)系
講座摘要:
美國國立衛(wèi)生研究院NIH資助建立網(wǎng)絡集成式細胞內(nèi)特征的公共數(shù)據(jù)(LINCS)項目,旨在開發(fā)細胞水平上藥物特性的生物學標簽,通過監(jiān)視細胞內(nèi)表型的變化動態(tài)反映藥物作用機制,使我們能迅速了解個體細胞的藥物功能基因組學和藥物代謝組學的特征。LINCS項目開發(fā)Connectivity Map(Cmap)數(shù)據(jù)庫,收集了使用化合物處理和相關基因干擾劑處理的人類細胞基因表達的信息像是一本藥物基因表達的目錄,利用高通量、低成本的檢測方案搜索Cmap數(shù)據(jù)庫將基因、疾病及藥物作一個連結(jié),進而揭秘中草藥、天然活性成分及小分子化合物的作用機制,發(fā)展新藥開發(fā)或老藥新用達到個體化醫(yī)療的目的。 另外,LINCS項目在線網(wǎng)絡分析平臺也為全球的科研人員提供個體化代謝組學的數(shù)據(jù)庫,旨在開發(fā)單細胞水平的藥物特性的代謝圖譜,利用高內(nèi)涵檢測技術可得到固定細胞中蛋白的免疫檢測,活細胞凋亡圖像分析,蛋白激酶生化分析以及細胞活力相關的生理參數(shù),為研究者和臨床診斷醫(yī)生探測單細胞個體分析和如何用藥提供了一個獨特的工具。 應用美國NIH LINCS大數(shù)據(jù)項目可獲得新藥開發(fā)整合式解決方案,加速常規(guī)的藥物研發(fā)周期、降低研發(fā)成本、多參數(shù)系統(tǒng)性揭示藥物治療疾病的新機制。

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